Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.68□□□□□ -1.34
USB1Q12208 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.68□□□□□ -1.34
USB1Q12208 PMA2YPL036W 2844 nt6.68□□□□□ -1.34
USB1Q12208 ARO3YDR035W 1113 nt6.67□□□□□ -1.34
USB1Q12208 ARG7YMR062C 1326 nt6.67□□□□□ -1.34
USB1Q12208 WSC4YHL028W 1818 nt6.66□□□□□ -1.34
USB1Q12208 ATP2YJR121W 1536 nt6.66□□□□□ -1.34
USB1Q12208 ALG7YBR243C 1347 nt6.66□□□□□ -1.34
USB1Q12208 JHD1YER051W 1479 nt6.66□□□□□ -1.34
USB1Q12208 SNP1YIL061C 903 nt6.65□□□□□ -1.34
USB1Q12208 YOR343CYOR343C 327 nt6.65□□□□□ -1.34
USB1Q12208 PAU21YOR394W 495 nt6.65□□□□□ -1.34
USB1Q12208 MNN9YPL050C 1188 nt6.65□□□□□ -1.34
USB1Q12208 PAU22YPL282C 495 nt6.65□□□□□ -1.34
USB1Q12208 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.64□□□□□ -1.35
USB1Q12208 HRA1HRA1 564 nt6.64□□□□□ -1.35
USB1Q12208 FIT1YDR534C 1587 nt6.64□□□□□ -1.35
USB1Q12208 MET30YIL046W 1923 nt6.64□□□□□ -1.35
USB1Q12208 MRP1YDR347W 966 nt6.63□□□□□ -1.35
USB1Q12208 GRH1YDR517W 1119 nt6.63□□□□□ -1.35
USB1Q12208 BUD20YLR074C 501 nt6.63□□□□□ -1.35
USB1Q12208 FRT1YOR324C 1809 nt6.62□□□□□ -1.35
USB1Q12208 YNL190WYNL190W 615 nt6.62□□□□□ -1.35
USB1Q12208 MDH2YOL126C 1134 nt6.62□□□□□ -1.35
USB1Q12208 DUS3YLR401C 2007 nt6.61□□□□□ -1.35
USB1Q12208 RPL12BYDR418W 498 nt6.61□□□□□ -1.35
USB1Q12208 TDH1YJL052W 999 nt6.61□□□□□ -1.35
USB1Q12208 ADA2YDR448W 1305 nt6.6□□□□□ -1.35
USB1Q12208 TES1YJR019C 1050 nt6.6□□□□□ -1.35
USB1Q12208 LAS17YOR181W 1902 nt6.6□□□□□ -1.35
USB1Q12208 GDH1YOR375C 1365 nt6.59□□□□□ -1.35
USB1Q12208 UTR5YEL035C 501 nt6.59□□□□□ -1.35
USB1Q12208 Q0010Q0010 387 nt6.59□□□□□ -1.35
USB1Q12208 BEM1YBR200W 1656 nt6.58□□□□□ -1.36
USB1Q12208 PFS2YNL317W 1398 nt6.58□□□□□ -1.36
USB1Q12208 YHR131CYHR131C 2553 nt6.58□□□□□ -1.36
USB1Q12208 YIL168WYIL168W 384 nt6.58□□□□□ -1.36
USB1Q12208 CDA1YLR307W 906 nt6.58□□□□□ -1.36
USB1Q12208 MTC6YHR151C 1581 nt6.57□□□□□ -1.36
USB1Q12208 SMC5YOL034W 3282 nt6.57□□□□□ -1.36
USB1Q12208 TAD2YJL035C 753 nt6.57□□□□□ -1.36
USB1Q12208 BAP3YDR046C 1815 nt6.56□□□□□ -1.36
USB1Q12208 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.56□□□□□ -1.36
USB1Q12208 CKB1YGL019W 837 nt6.56□□□□□ -1.36
USB1Q12208 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.56□□□□□ -1.36
USB1Q12208 SLM3YDL033C 1254 nt6.55□□□□□ -1.36
USB1Q12208 ELP6YMR312W 822 nt6.55□□□□□ -1.36
USB1Q12208 RSC9YML127W 1746 nt6.55□□□□□ -1.36
USB1Q12208 AVL9YLR114C 2295 nt6.54□□□□□ -1.36
USB1Q12208 YHR033WYHR033W 1272 nt6.54□□□□□ -1.36
USB1Q12208 CPR2YHR057C 618 nt6.54□□□□□ -1.36
USB1Q12208 AOS1YPR180W 1044 nt6.54□□□□□ -1.36
USB1Q12208 ELP4YPL101W 1371 nt6.54□□□□□ -1.36
USB1Q12208 HSV2YGR223C 1347 nt6.53□□□□□ -1.36
USB1Q12208 HAM1YJR069C 594 nt6.53□□□□□ -1.36
USB1Q12208 AFG2YLR397C 2343 nt6.53□□□□□ -1.36
USB1Q12208 MET13YGL125W 1803 nt6.53□□□□□ -1.36
USB1Q12208 HEL1YKR017C 1656 nt6.52□□□□□ -1.37
USB1Q12208 CRN1YLR429W 1956 nt6.52□□□□□ -1.37
USB1Q12208 DST1YGL043W 930 nt6.52□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PSP2YML017W 1782 nt6.52□□□□□ -1.37
USB1Q12208 CMK2YOL016C 1344 nt6.51□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PMT7YDR307W 1989 nt6.51□□□□□ -1.37
USB1Q12208 EDC2YER035W 438 nt6.51□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PET10YKR046C 852 nt6.51□□□□□ -1.37
USB1Q12208 SPR1YOR190W 1338 nt6.5□□□□□ -1.37
USB1Q12208 APT1YML022W 564 nt6.5□□□□□ -1.37
USB1Q12208 CPT1YNL130C 1182 nt6.49□□□□□ -1.37
USB1Q12208 NUP53YMR153W 1428 nt6.49□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 RRT6YGL146C 936 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PMT1YDL095W 2454 nt6.48□□□□□ -1.37
USB1Q12208 YDR476CYDR476C 675 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 SNF7YLR025W 723 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 ADE1YAR015W 921 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 CTF3YLR381W 2202 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PEX28YHR150W 1740 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 PNS1YOR161C 1620 nt6.47□□□□□ -1.37
USB1Q12208 TPO1YLL028W 1761 nt6.46□□□□□ -1.37
USB1Q12208 SGF73YGL066W 1974 nt6.46□□□□□ -1.37
USB1Q12208 STE3YKL178C 1413 nt6.46□□□□□ -1.38
USB1Q12208 INP54YOL065C 1155 nt6.46□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YIL108WYIL108W 2091 nt6.46□□□□□ -1.38
USB1Q12208 GGC1YDL198C 903 nt6.45□□□□□ -1.38
USB1Q12208 FUS3YBL016W 1062 nt6.45□□□□□ -1.38
USB1Q12208 RCF2YNR018W 675 nt6.45□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YPL264CYPL264C 1062 nt6.45□□□□□ -1.38
USB1Q12208 RRP43YCR035C 1185 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 GET2YER083C 858 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 CAR2YLR438W 1275 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YCR061WYCR061W 1896 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 YNL295WYNL295W 1575 nt6.44□□□□□ -1.38
USB1Q12208 LEO1YOR123C 1395 nt6.44□□□□□ -1.38
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