Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCRN3Q0VDG4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCRN3Q0VDG4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCRN3Q0VDG4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms