Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
LMOD3Q0VAK6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD3Q0VAK6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD3Q0VAK6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD3Q0VAK6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD3Q0VAK6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms