Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FAM27E3Q08E93 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FAM27E3Q08E93 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM27E3Q08E93 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM27E3Q08E93 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM27E3Q08E93 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms