Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C2orf54Q08AI8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
C2orf54Q08AI8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
C2orf54Q08AI8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
C2orf54Q08AI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
C2orf54Q08AI8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms