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Protein–RNA interactions for Protein: Q08490
SGO1, Shugoshin, yeast
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590 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SGO1
Q08490
YNL190W
YNL190W
615 nt
8.05
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
YLR173W
YLR173W
1827 nt
8.05
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
SLM3
YDL033C
1254 nt
8.04
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
URH1
YDR400W
1023 nt
8.04
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
YDR467C
YDR467C
327 nt
8.03
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
YHL030W-A
YHL030W-A
462 nt
8.03
□□□□□ -1.12
SGO1
Q08490
FTH1
YBR207W
1398 nt
8.02
□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
PIH1
YHR034C
1035 nt
8.02
□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
LAS17
YOR181W
1902 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
PFS2
YNL317W
1398 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
YAL019W-A
YAL019W-A
570 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
MAS2
YHR024C
1449 nt
8.01
□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
NCA3
YJL116C
1014 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
HSV2
YGR223C
1347 nt
8
□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
REG2
YBR050C
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
RHO1
YPR165W
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7.99
□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
YOX1
YML027W
1158 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
CPT1
YNL130C
1182 nt
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□□□□□ -1.13
SGO1
Q08490
YTH1
YPR107C
627 nt
7.96
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
GCD11
YER025W
1584 nt
7.96
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
MCM5
YLR274W
2328 nt
7.95
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
SHC1
YER096W
1539 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
PNS1
YOR161C
1620 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
POR2
YIL114C
846 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
YLR122C
YLR122C
378 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
AIM34
YMR003W
597 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
PUS4
YNL292W
1212 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
ATP23
YNR020C
813 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
SPR1
YOR190W
1338 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
AAT1
YKL106W
1356 nt
7.94
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
YMR316C-B
YMR316C-B
309 nt
7.93
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
THI73
YLR004C
1572 nt
7.93
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
PUS7
YOR243C
2031 nt
7.92
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
JHD1
YER051W
1479 nt
7.92
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
AI5_BETA
Q0075
1065 nt
7.91
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
PUP3
YER094C
618 nt
7.91
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
PMU1
YKL128C
888 nt
7.91
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
MDH2
YOL126C
1134 nt
7.91
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
DIA4
YHR011W
1341 nt
7.91
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
YLR072W
YLR072W
2082 nt
7.9
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
UME1
YPL139C
1383 nt
7.9
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
YIR035C
YIR035C
765 nt
7.9
□□□□□ -1.14
SGO1
Q08490
THI3
YDL080C
1830 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
GGA2
YHR108W
1758 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
TIM50
YPL063W
1431 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
PAM17
YKR065C
594 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
ARA2
YMR041C
1008 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
YBL111C
YBL111C
2004 nt
7.89
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
FAF1
YIL019W
1041 nt
7.88
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
MCP1
YOR228C
909 nt
7.88
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
ECM10
YEL030W
1935 nt
7.88
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
CHA1
YCL064C
1083 nt
7.87
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
GPM1
YKL152C
744 nt
7.87
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
ITR1
YDR497C
1755 nt
7.87
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
CYS3
YAL012W
1185 nt
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□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
APT1
YML022W
564 nt
7.86
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
PMA2
YPL036W
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7.86
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
FRT1
YOR324C
1809 nt
7.85
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
PRC1
YMR297W
1599 nt
7.84
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
PMT7
YDR307W
1989 nt
7.84
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
YIL177C
YIL177C
5277 nt
7.84
□□□□□ -1.15
SGO1
Q08490
YRF1-1
YDR545W
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□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
YRF1-5
YLR467W
5391 nt
7.84
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SGO1
Q08490
YRF1-8
YOR396W
5391 nt
7.84
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
ADE2
YOR128C
1716 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
KDX1
YKL161C
1302 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
TOP3
YLR234W
1971 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
CRN1
YLR429W
1956 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
GAL83
YER027C
1254 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
TOM20
YGR082W
552 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
PUS5
YLR165C
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7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
PRE10
YOR362C
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7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
YMC2
YBR104W
990 nt
7.83
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
MEP1
YGR121C
1479 nt
7.82
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
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YMR055C
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7.82
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
TMS1
YDR105C
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□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
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YBL057C
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SGO1
Q08490
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YOL092W
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7.81
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
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YNL310C
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SGO1
Q08490
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YNL331C
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□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
LEA1
YPL213W
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□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
PMP3
YDR276C
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7.79
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
AIM46
YHR199C
933 nt
7.79
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
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YBR085W
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7.79
□□□□□ -1.16
SGO1
Q08490
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YDL198C
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SGO1
Q08490
SPE3
YPR069C
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SGO1
Q08490
MAM3
YOL060C
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SGO1
Q08490
NDE1
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SGO1
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Q08490
ADH6
YMR318C
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SGO1
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MBF1
YOR298C-A
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□□□□□ -1.17
SGO1
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1710 nt
7.77
□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
SPE4
YLR146C
903 nt
7.76
□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
ATP10
YLR393W
840 nt
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□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
CST26
YBR042C
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□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
ABP1
YCR088W
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□□□□□ -1.17
SGO1
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SNU66
YOR308C
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□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
PLB3
YOL011W
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□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
CKI1
YLR133W
1749 nt
7.75
□□□□□ -1.17
SGO1
Q08490
YMR074C
YMR074C
438 nt
7.75
□□□□□ -1.17
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