Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC3A1Q07837 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC3A1Q07837 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC3A1Q07837 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC3A1Q07837 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms