Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
COL16A1Q07092 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
COL16A1Q07092 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
COL16A1Q07092 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
COL16A1Q07092 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
COL16A1Q07092 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
COL16A1Q07092 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 384 ms