Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CKAP4Q07065 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CKAP4Q07065 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CKAP4Q07065 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CKAP4Q07065 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CKAP4Q07065 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms