Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PSME1Q06323 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PSME1Q06323 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PSME1Q06323 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PSME1Q06323 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
PSME1Q06323 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PSME1Q06323 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms