Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
CTDSPL2Q05D32 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CTDSPL2Q05D32 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CTDSPL2Q05D32 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTDSPL2Q05D32 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CTDSPL2Q05D32 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTDSPL2Q05D32 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTDSPL2Q05D32 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTDSPL2Q05D32 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTDSPL2Q05D32 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms