Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPN12Q05209 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPN12Q05209 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTPN12Q05209 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTPN12Q05209 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTPN12Q05209 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms