Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SSBP1Q04837 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SSBP1Q04837 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SSBP1Q04837 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP1Q04837 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP1Q04837 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP1Q04837 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SSBP1Q04837 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SSBP1Q04837 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SSBP1Q04837 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.9 ms