Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PRKCQQ04759 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PRKCQQ04759 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PRKCQQ04759 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRKCQQ04759 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRKCQQ04759 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms