Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KRT17Q04695 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT17Q04695 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT17Q04695 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT17Q04695 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT17Q04695 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT17Q04695 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT17Q04695 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT17Q04695 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT17Q04695 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT17Q04695 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT17Q04695 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT17Q04695 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT17Q04695 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
KRT17Q04695 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT17Q04695 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
KRT17Q04695 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.52■■■□□ 2
KRT17Q04695 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT17Q04695 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT17Q04695 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT17Q04695 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
KRT17Q04695 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT17Q04695 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT17Q04695 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms