Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF85Q03923 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF85Q03923 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF85Q03923 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF85Q03923 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF85Q03923 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms