Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SP4Q02446 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SP4Q02446 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SP4Q02446 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SP4Q02446 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SP4Q02446 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP4Q02446 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP4Q02446 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SP4Q02446 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SP4Q02446 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP4Q02446 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP4Q02446 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SP4Q02446 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP4Q02446 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP4Q02446 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SP4Q02446 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP4Q02446 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SP4Q02446 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP4Q02446 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP4Q02446 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SP4Q02446 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SP4Q02446 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SP4Q02446 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SP4Q02446 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP4Q02446 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP4Q02446 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP4Q02446 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SP4Q02446 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP4Q02446 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SP4Q02446 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SP4Q02446 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SP4Q02446 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SP4Q02446 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SP4Q02446 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SP4Q02446 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP4Q02446 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP4Q02446 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP4Q02446 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP4Q02446 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SP4Q02446 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP4Q02446 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP4Q02446 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SP4Q02446 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SP4Q02446 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP4Q02446 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SP4Q02446 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SP4Q02446 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP4Q02446 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP4Q02446 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SP4Q02446 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP4Q02446 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP4Q02446 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SP4Q02446 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SP4Q02446 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP4Q02446 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SP4Q02446 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SP4Q02446 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP4Q02446 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
SP4Q02446 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SP4Q02446 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SP4Q02446 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SP4Q02446 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SP4Q02446 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP4Q02446 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP4Q02446 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SP4Q02446 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SP4Q02446 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP4Q02446 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP4Q02446 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP4Q02446 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SP4Q02446 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP4Q02446 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP4Q02446 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SP4Q02446 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP4Q02446 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SP4Q02446 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP4Q02446 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
SP4Q02446 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP4Q02446 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP4Q02446 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SP4Q02446 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SP4Q02446 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SP4Q02446 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP4Q02446 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SP4Q02446 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms