Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIBQ01892 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIBQ01892 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SPIBQ01892 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SPIBQ01892 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms