Protein–RNA interactions for Protein: Q00973

B4GALNT1, Beta-1,4 N-acetylgalactosaminyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4GALNT1Q00973 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
B4GALNT1Q00973 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
B4GALNT1Q00973 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
B4GALNT1Q00973 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
B4GALNT1Q00973 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4GALNT1Q00973 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
B4GALNT1Q00973 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms