Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLDN10P78369 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN10P78369 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN10P78369 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLDN10P78369 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN10P78369 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN10P78369 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLDN10P78369 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CLDN10P78369 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN10P78369 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CLDN10P78369 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN10P78369 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN10P78369 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CLDN10P78369 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLDN10P78369 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLDN10P78369 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLDN10P78369 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLDN10P78369 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN10P78369 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN10P78369 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms