Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FAM193AP78312 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM193AP78312 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM193AP78312 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM193AP78312 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM193AP78312 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms