Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC1P63316 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNC1P63316 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
TNNC1P63316 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
TNNC1P63316 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC1P63316 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC1P63316 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC1P63316 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC1P63316 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TNNC1P63316 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TNNC1P63316 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TNNC1P63316 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNC1P63316 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNC1P63316 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TNNC1P63316 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.52■■■□□ 2
TNNC1P63316 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TNNC1P63316 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TNNC1P63316 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TNNC1P63316 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TNNC1P63316 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms