Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1AP62820 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1AP62820 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB1AP62820 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB1AP62820 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB1AP62820 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms