Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NCS1P62166 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NCS1P62166 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCS1P62166 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCS1P62166 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NCS1P62166 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCS1P62166 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NCS1P62166 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCS1P62166 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NCS1P62166 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCS1P62166 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCS1P62166 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NCS1P62166 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCS1P62166 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NCS1P62166 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCS1P62166 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NCS1P62166 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCS1P62166 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCS1P62166 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCS1P62166 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCS1P62166 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCS1P62166 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCS1P62166 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCS1P62166 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCS1P62166 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCS1P62166 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCS1P62166 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCS1P62166 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCS1P62166 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCS1P62166 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCS1P62166 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCS1P62166 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCS1P62166 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCS1P62166 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCS1P62166 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCS1P62166 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCS1P62166 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCS1P62166 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCS1P62166 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCS1P62166 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCS1P62166 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NCS1P62166 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NCS1P62166 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCS1P62166 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NCS1P62166 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCS1P62166 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCS1P62166 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCS1P62166 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NCS1P62166 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NCS1P62166 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCS1P62166 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCS1P62166 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCS1P62166 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCS1P62166 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NCS1P62166 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCS1P62166 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCS1P62166 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCS1P62166 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NCS1P62166 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NCS1P62166 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NCS1P62166 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCS1P62166 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCS1P62166 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCS1P62166 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NCS1P62166 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCS1P62166 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCS1P62166 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCS1P62166 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NCS1P62166 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCS1P62166 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NCS1P62166 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NCS1P62166 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NCS1P62166 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms