Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ERVK-21P61565 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ERVK-21P61565 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ERVK-21P61565 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVK-21P61565 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVK-21P61565 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms