Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA9P57773 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA9P57773 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA9P57773 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJA9P57773 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJA9P57773 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GJA9P57773 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA9P57773 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA9P57773 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA9P57773 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJA9P57773 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA9P57773 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA9P57773 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJA9P57773 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA9P57773 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA9P57773 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJA9P57773 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA9P57773 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA9P57773 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJA9P57773 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GJA9P57773 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA9P57773 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GJA9P57773 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA9P57773 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GJA9P57773 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA9P57773 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA9P57773 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA9P57773 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA9P57773 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GJA9P57773 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GJA9P57773 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA9P57773 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA9P57773 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GJA9P57773 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GJA9P57773 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GJA9P57773 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GJA9P57773 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA9P57773 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GJA9P57773 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GJA9P57773 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GJA9P57773 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA9P57773 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GJA9P57773 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GJA9P57773 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA9P57773 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA9P57773 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA9P57773 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GJA9P57773 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GJA9P57773 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA9P57773 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA9P57773 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA9P57773 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA9P57773 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GJA9P57773 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA9P57773 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA9P57773 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJA9P57773 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA9P57773 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJA9P57773 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA9P57773 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA9P57773 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA9P57773 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJA9P57773 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms