Protein–RNA interactions for Protein: P57103

SLC8A3, Sodium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 927 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A3P57103 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A3P57103 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A3P57103 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC8A3P57103 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC8A3P57103 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC8A3P57103 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC8A3P57103 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC8A3P57103 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC8A3P57103 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC8A3P57103 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms