Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
H2BFSP57053 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
H2BFSP57053 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
H2BFSP57053 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
H2BFSP57053 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
H2BFSP57053 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms