Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSCP56915 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GSCP56915 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GSCP56915 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSCP56915 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GSCP56915 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSCP56915 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GSCP56915 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSCP56915 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSCP56915 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GSCP56915 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GSCP56915 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSCP56915 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSCP56915 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSCP56915 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GSCP56915 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSCP56915 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSCP56915 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSCP56915 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSCP56915 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GSCP56915 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSCP56915 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSCP56915 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GSCP56915 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GSCP56915 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GSCP56915 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GSCP56915 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSCP56915 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSCP56915 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSCP56915 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GSCP56915 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
GSCP56915 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSCP56915 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSCP56915 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSCP56915 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GSCP56915 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSCP56915 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSCP56915 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSCP56915 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GSCP56915 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GSCP56915 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GSCP56915 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSCP56915 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSCP56915 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSCP56915 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GSCP56915 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSCP56915 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GSCP56915 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GSCP56915 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSCP56915 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSCP56915 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSCP56915 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSCP56915 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GSCP56915 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSCP56915 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSCP56915 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GSCP56915 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSCP56915 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GSCP56915 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSCP56915 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSCP56915 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GSCP56915 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSCP56915 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GSCP56915 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSCP56915 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GSCP56915 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSCP56915 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GSCP56915 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSCP56915 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GSCP56915 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GSCP56915 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSCP56915 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSCP56915 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSCP56915 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSCP56915 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GSCP56915 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSCP56915 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
GSCP56915 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSCP56915 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GSCP56915 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms