Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARL4CP56559 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ARL4CP56559 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ARL4CP56559 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARL4CP56559 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARL4CP56559 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms