Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SUMO3P55854 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SUMO3P55854 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SUMO3P55854 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms