Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MFAP3P55082 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MFAP3P55082 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MFAP3P55082 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MFAP3P55082 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MFAP3P55082 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms