Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EPHA4P54764 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EPHA4P54764 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHA4P54764 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHA4P54764 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms