Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ATXN3P54252 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATXN3P54252 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN3P54252 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATXN3P54252 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATXN3P54252 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms