Protein–RNA interactions for Protein: P53985

SLC16A1, Monocarboxylate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC16A1P53985 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC16A1P53985 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC16A1P53985 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC16A1P53985 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms