Protein–RNA interactions for Protein: P53947

YNL058C, Vacuolar membrane protein YNL058C, yeastyeast

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL058CP53947 RNA170RNA170 169 nt7.87□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 KTR4YBR199W 1395 nt7.86□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 NAP1YKR048C 1254 nt7.86□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 PAU19YMR325W 375 nt7.86□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 MRN1YPL184C 1839 nt7.86□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 PDC6YGR087C 1692 nt7.86□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 PUP3YER094C 618 nt7.84□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 CSM2YIL132C 642 nt7.84□□□□□ -1.15
YNL058CP53947 BIM1YER016W 1035 nt7.83□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 SNP1YIL061C 903 nt7.83□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 AIM34YMR003W 597 nt7.83□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YMR206WYMR206W 942 nt7.83□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 ITR1YDR497C 1755 nt7.82□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 SLM3YDL033C 1254 nt7.82□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YPL108WYPL108W 507 nt7.82□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 PMT7YDR307W 1989 nt7.82□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 DIP5YPL265W 1827 nt7.82□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 ARO3YDR035W 1113 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 MNN9YPL050C 1188 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 SHC1YER096W 1539 nt7.81□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 ALG7YBR243C 1347 nt7.8□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 MTC6YHR151C 1581 nt7.8□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YIL108WYIL108W 2091 nt7.8□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 CTF3YLR381W 2202 nt7.79□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 RRT14YIL127C 621 nt7.79□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 PRE10YOR362C 867 nt7.79□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YPR084WYPR084W 1371 nt7.79□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 MSB3YNL293W 1902 nt7.78□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 GGC1YDL198C 903 nt7.78□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.78□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 ADH6YMR318C 1083 nt7.78□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 TOP3YLR234W 1971 nt7.78□□□□□ -1.16
YNL058CP53947 YPL264CYPL264C 1062 nt7.77□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 HXT8YJL214W 1710 nt7.77□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 ADE17YMR120C 1779 nt7.76□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 PRC1YMR297W 1599 nt7.76□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 SAM50YNL026W 1455 nt7.75□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 WSC4YHL028W 1818 nt7.75□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.74□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 TES1YJR019C 1050 nt7.74□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 RPS6AYPL090C 711 nt7.74□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 RPS6BYBR181C 711 nt7.74□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 PRP2YNR011C 2631 nt7.73□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 CKB1YGL019W 837 nt7.72□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 HAM1YJR069C 594 nt7.72□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 RGT2YDL138W 2292 nt7.72□□□□□ -1.17
YNL058CP53947 RRT6YGL146C 936 nt7.71□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 CDA1YLR307W 906 nt7.71□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 RSC9YML127W 1746 nt7.71□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 AVL9YLR114C 2295 nt7.71□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 YIP4YGL198W 708 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 NAS6YGR232W 687 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 ELP6YMR312W 822 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 BXI1YNL305C 894 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 SLG1YOR008C 1137 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 RCR1YBR005W 642 nt7.7□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 YCP4YCR004C 744 nt7.69□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 PET18YCR020C 648 nt7.69□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 YMR007WYMR007W 381 nt7.69□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 ARG7YMR062C 1326 nt7.69□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 TIM50YPL063W 1431 nt7.69□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 PMU1YKL128C 888 nt7.68□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 AOS1YPR180W 1044 nt7.68□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 CHA1YCL064C 1083 nt7.67□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 MFT1YML062C 1179 nt7.67□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 JHD1YER051W 1479 nt7.67□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 TOS2YGR221C 1869 nt7.66□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 HXT13YEL069C 1695 nt7.66□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 MET13YGL125W 1803 nt7.65□□□□□ -1.18
YNL058CP53947 HSM3YBR272C 1443 nt7.64□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 LEO1YOR123C 1395 nt7.64□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YJL160CYJL160C 864 nt7.64□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YOR041CYOR041C 432 nt7.64□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 SGV1YPR161C 1974 nt7.64□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 SPE4YLR146C 903 nt7.63□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 PUP1YOR157C 786 nt7.63□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 GPA1YHR005C 1419 nt7.62□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 CDC13YDL220C 2775 nt7.62□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 HXT9YJL219W 1704 nt7.62□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 DST1YGL043W 930 nt7.62□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 RCF2YNR018W 675 nt7.61□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 SGF73YGL066W 1974 nt7.6□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YHR033WYHR033W 1272 nt7.6□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YIL168WYIL168W 384 nt7.6□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.6□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 TPO1YLL028W 1761 nt7.6□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YER152CYER152C 1332 nt7.59□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 SWM1YDR260C 513 nt7.59□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 ATP10YLR393W 840 nt7.59□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 YOR300WYOR300W 309 nt7.59□□□□□ -1.19
YNL058CP53947 ERR3YMR323W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ERR1YOR393W 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 ERR2YPL281C 1314 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 HGH1YGR187C 1185 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 PET10YKR046C 852 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 YPC1YBR183W 951 nt7.58□□□□□ -1.2
YNL058CP53947 AIM3YBR108W 2844 nt7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 108.3 ms