Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	YLR030W	YLR030W	792 nt		7.58	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	CIR2	YOR356W	1896 nt		7.58	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	PPS1	YBR276C	2424 nt		7.57	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	YIP4	YGL198W	708 nt		7.57	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	YLR349W	YLR349W	507 nt		7.57	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	MET22	YOL064C	1074 nt		7.57	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	AGP2	YBR132C	1791 nt		7.56	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	PAU5	YFL020C	369 nt		7.56	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	RNA170	RNA170	169 nt		7.55	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	SSC1	YJR045C	1965 nt		7.55	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	YGR068W-A	YGR068W-A	96 nt		7.54	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	CYC3	YAL039C	810 nt		7.54	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	YLR280C	YLR280C	351 nt		7.54	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	VTS1	YOR359W	1572 nt		7.54	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	ARO3	YDR035W	1113 nt		7.53	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	STP3	YLR375W	1032 nt		7.53	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	RCF2	YNR018W	675 nt		7.53	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	YHR131C	YHR131C	2553 nt		7.53	□□□□□ -1.2
DSL1	P53847	PDC6	YGR087C	1692 nt		7.52	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	FLX1	YIL134W	936 nt		7.52	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	SRP102	YKL154W	735 nt		7.52	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	ALG7	YBR243C	1347 nt		7.52	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	MAL31	YBR298C	1845 nt		7.51	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	ADH7	YCR105W	1086 nt		7.51	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	RHO1	YPR165W	630 nt		7.51	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	MET8	YBR213W	825 nt		7.51	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	YOR389W	YOR389W	1875 nt		7.51	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	YHL030W-A	YHL030W-A	462 nt		7.5	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	THI73	YLR004C	1572 nt		7.5	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)D	tA(AGC)D	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)F	tA(AGC)F	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)G	tA(AGC)G	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)H	tA(AGC)H	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)J	tA(AGC)J	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)K1	tA(AGC)K1	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)K2	tA(AGC)K2	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)L	tA(AGC)L	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)M1	tA(AGC)M1	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)M2	tA(AGC)M2	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	tA(AGC)P	tA(AGC)P	73 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	CKB1	YGL019W	837 nt		7.49	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	PRB1	YEL060C	1908 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	PUP3	YER094C	618 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	OCH1	YGL038C	1443 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	YNR001W-A	YNR001W-A	219 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	IPL1	YPL209C	1104 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	ERG12	YMR208W	1332 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	AVL9	YLR114C	2295 nt		7.48	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	GNA1	YFL017C	480 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	SNP1	YIL061C	903 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	PAU15	YIR041W	375 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	TES1	YJR019C	1050 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	YKR018C	YKR018C	2178 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	ERO1	YML130C	1692 nt		7.47	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	MTC6	YHR151C	1581 nt		7.46	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	SGE1	YPR198W	1632 nt		7.46	□□□□□ -1.21
DSL1	P53847	HRA1	HRA1	564 nt		7.46	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	PGC1	YPL206C	966 nt		7.46	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	PMT1	YDL095W	2454 nt		7.46	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	YER152W-A	YER152W-A	567 nt		7.45	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	CDA1	YLR307W	906 nt		7.45	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	ELP6	YMR312W	822 nt		7.45	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	TOD6	YBL054W	1578 nt		7.45	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	HXT8	YJL214W	1710 nt		7.44	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	YPT31	YER031C	672 nt		7.44	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	YMR166C	YMR166C	1107 nt		7.44	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	RFS1	YBR052C	633 nt		7.44	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	CAK1	YFL029C	1107 nt		7.43	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	MEU1	YLR017W	1014 nt		7.43	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	PEX28	YHR150W	1740 nt		7.42	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	YOR041C	YOR041C	432 nt		7.42	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	SHC1	YER096W	1539 nt		7.42	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	GTS1	YGL181W	1191 nt		7.41	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	tS(GCU)L	tS(GCU)L	80 nt		7.41	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	TPO1	YLL028W	1761 nt		7.41	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	YCR025C	YCR025C	411 nt		7.4	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	BIM1	YER016W	1035 nt		7.4	□□□□□ -1.22
DSL1	P53847	PDC5	YLR134W	1692 nt		7.39	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	PRE10	YOR362C	867 nt		7.39	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	MNN9	YPL050C	1188 nt		7.39	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	RUP1	YOR138C	2016 nt		7.39	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	PPZ2	YDR436W	2133 nt		7.38	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	RRT14	YIL127C	621 nt		7.38	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	YBR232C	YBR232C	360 nt		7.38	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	SEC24	YIL109C	2781 nt		7.38	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	UBP13	YBL067C	2244 nt		7.37	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	DAL4	YIR028W	1908 nt		7.37	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	LSP1	YPL004C	1026 nt		7.37	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	CAN1	YEL063C	1773 nt		7.36	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	YGR210C	YGR210C	1236 nt		7.36	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	ECM30	YLR436C	3825 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	HTS1	YPR033C	1641 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	SER2	YGR208W	930 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	HAM1	YJR069C	594 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	AOS1	YPR180W	1044 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	TIM50	YPL063W	1431 nt		7.35	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	CDC23	YHR166C	1881 nt		7.34	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	LEO1	YOR123C	1395 nt		7.34	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	RAD51	YER095W	1203 nt		7.34	□□□□□ -1.23
DSL1	P53847	EMP65	YER140W	1671 nt		7.34	□□□□□ -1.23

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