Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUCLG1P53597 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUCLG1P53597 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUCLG1P53597 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUCLG1P53597 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms