Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC25A1P53007 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC25A1P53007 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC25A1P53007 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A1P53007 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms