Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THOP1P52888 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
THOP1P52888 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THOP1P52888 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THOP1P52888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THOP1P52888 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THOP1P52888 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THOP1P52888 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THOP1P52888 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THOP1P52888 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THOP1P52888 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THOP1P52888 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
THOP1P52888 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
THOP1P52888 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
THOP1P52888 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
THOP1P52888 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THOP1P52888 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THOP1P52888 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THOP1P52888 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THOP1P52888 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THOP1P52888 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
THOP1P52888 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
THOP1P52888 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
THOP1P52888 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
THOP1P52888 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THOP1P52888 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
THOP1P52888 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THOP1P52888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THOP1P52888 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THOP1P52888 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THOP1P52888 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
THOP1P52888 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
THOP1P52888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THOP1P52888 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THOP1P52888 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THOP1P52888 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THOP1P52888 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
THOP1P52888 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THOP1P52888 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
THOP1P52888 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
THOP1P52888 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THOP1P52888 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THOP1P52888 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
THOP1P52888 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THOP1P52888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
THOP1P52888 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
THOP1P52888 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THOP1P52888 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THOP1P52888 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
THOP1P52888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THOP1P52888 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THOP1P52888 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THOP1P52888 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THOP1P52888 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THOP1P52888 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THOP1P52888 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THOP1P52888 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
THOP1P52888 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms