Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EFNA3P52797 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EFNA3P52797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EFNA3P52797 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EFNA3P52797 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms