Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HK3P52790 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HK3P52790 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HK3P52790 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HK3P52790 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HK3P52790 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HK3P52790 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HK3P52790 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HK3P52790 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HK3P52790 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HK3P52790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HK3P52790 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HK3P52790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HK3P52790 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HK3P52790 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HK3P52790 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HK3P52790 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HK3P52790 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HK3P52790 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HK3P52790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HK3P52790 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HK3P52790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HK3P52790 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HK3P52790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HK3P52790 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HK3P52790 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HK3P52790 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HK3P52790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HK3P52790 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HK3P52790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HK3P52790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HK3P52790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HK3P52790 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HK3P52790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HK3P52790 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HK3P52790 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HK3P52790 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HK3P52790 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HK3P52790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HK3P52790 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HK3P52790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HK3P52790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HK3P52790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HK3P52790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HK3P52790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HK3P52790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HK3P52790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HK3P52790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HK3P52790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HK3P52790 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HK3P52790 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HK3P52790 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HK3P52790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HK3P52790 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HK3P52790 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HK3P52790 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HK3P52790 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HK3P52790 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HK3P52790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HK3P52790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HK3P52790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HK3P52790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HK3P52790 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HK3P52790 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HK3P52790 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HK3P52790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HK3P52790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HK3P52790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HK3P52790 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HK3P52790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HK3P52790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms