Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMSP52788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMSP52788 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMSP52788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMSP52788 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMSP52788 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMSP52788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMSP52788 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMSP52788 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMSP52788 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMSP52788 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMSP52788 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMSP52788 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMSP52788 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMSP52788 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMSP52788 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMSP52788 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMSP52788 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMSP52788 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMSP52788 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMSP52788 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMSP52788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMSP52788 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMSP52788 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMSP52788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMSP52788 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMSP52788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMSP52788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMSP52788 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMSP52788 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMSP52788 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMSP52788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMSP52788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMSP52788 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMSP52788 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMSP52788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMSP52788 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMSP52788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMSP52788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMSP52788 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMSP52788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMSP52788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMSP52788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMSP52788 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMSP52788 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMSP52788 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMSP52788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMSP52788 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMSP52788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMSP52788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMSP52788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMSP52788 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMSP52788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMSP52788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMSP52788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMSP52788 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMSP52788 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMSP52788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMSP52788 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMSP52788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMSP52788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMSP52788 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMSP52788 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMSP52788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms