Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLCNKBP51801 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLCNKBP51801 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CLCNKBP51801 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLCNKBP51801 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCNKBP51801 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCNKBP51801 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCNKBP51801 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCNKBP51801 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCNKBP51801 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms