Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLCN2P51788 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLCN2P51788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCN2P51788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN2P51788 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN2P51788 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms