Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
GPC3P51654 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC3P51654 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
GPC3P51654 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC3P51654 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
GPC3P51654 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC3P51654 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC3P51654 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC3P51654 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
GPC3P51654 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPC3P51654 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
GPC3P51654 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC3P51654 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC3P51654 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC3P51654 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
GPC3P51654 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC3P51654 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC3P51654 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
GPC3P51654 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC3P51654 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC3P51654 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC3P51654 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
GPC3P51654 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC3P51654 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
GPC3P51654 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC3P51654 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC3P51654 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC3P51654 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
GPC3P51654 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
GPC3P51654 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
GPC3P51654 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC3P51654 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC3P51654 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC3P51654 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC3P51654 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GPC3P51654 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC3P51654 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC3P51654 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC3P51654 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
GPC3P51654 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC3P51654 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC3P51654 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC3P51654 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GPC3P51654 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC3P51654 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GPC3P51654 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
GPC3P51654 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GPC3P51654 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC3P51654 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC3P51654 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
GPC3P51654 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC3P51654 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC3P51654 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC3P51654 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GPC3P51654 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GPC3P51654 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC3P51654 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC3P51654 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GPC3P51654 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPC3P51654 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC3P51654 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GPC3P51654 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GPC3P51654 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC3P51654 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC3P51654 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC3P51654 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPC3P51654 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms