Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRCA2P51587 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
BRCA2P51587 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
BRCA2P51587 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRCA2P51587 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRCA2P51587 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms