Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RAB27AP51159 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAB27AP51159 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RAB27AP51159 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RAB27AP51159 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB27AP51159 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RAB27AP51159 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RAB27AP51159 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB27AP51159 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RAB27AP51159 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB27AP51159 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RAB27AP51159 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB27AP51159 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB27AP51159 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RAB27AP51159 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RAB27AP51159 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB27AP51159 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RAB27AP51159 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAB27AP51159 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RAB27AP51159 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RAB27AP51159 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RAB27AP51159 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RAB27AP51159 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RAB27AP51159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms