Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8P50990 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8P50990 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCT8P50990 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8P50990 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8P50990 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8P50990 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8P50990 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8P50990 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8P50990 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8P50990 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8P50990 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8P50990 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8P50990 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8P50990 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT8P50990 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT8P50990 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT8P50990 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT8P50990 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8P50990 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8P50990 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8P50990 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8P50990 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8P50990 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8P50990 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8P50990 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8P50990 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCT8P50990 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCT8P50990 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8P50990 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8P50990 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8P50990 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8P50990 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8P50990 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8P50990 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8P50990 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8P50990 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8P50990 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8P50990 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8P50990 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8P50990 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8P50990 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8P50990 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8P50990 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8P50990 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8P50990 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8P50990 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8P50990 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCT8P50990 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8P50990 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8P50990 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8P50990 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8P50990 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8P50990 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8P50990 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8P50990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8P50990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8P50990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8P50990 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8P50990 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8P50990 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8P50990 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8P50990 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8P50990 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8P50990 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8P50990 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8P50990 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8P50990 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8P50990 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8P50990 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8P50990 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8P50990 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8P50990 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8P50990 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8P50990 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8P50990 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8P50990 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8P50990 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8P50990 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8P50990 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8P50990 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8P50990 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8P50990 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8P50990 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8P50990 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8P50990 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT8P50990 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8P50990 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8P50990 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms