Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTPAP49638 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTPAP49638 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTPAP49638 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTPAP49638 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTPAP49638 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTPAP49638 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTPAP49638 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTPAP49638 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTPAP49638 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTPAP49638 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTPAP49638 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTPAP49638 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTPAP49638 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTPAP49638 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTPAP49638 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TTPAP49638 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TTPAP49638 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTPAP49638 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTPAP49638 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTPAP49638 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTPAP49638 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TTPAP49638 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTPAP49638 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTPAP49638 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTPAP49638 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTPAP49638 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTPAP49638 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTPAP49638 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTPAP49638 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTPAP49638 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTPAP49638 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTPAP49638 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTPAP49638 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTPAP49638 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTPAP49638 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTPAP49638 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTPAP49638 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTPAP49638 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTPAP49638 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTPAP49638 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTPAP49638 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTPAP49638 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTPAP49638 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTPAP49638 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTPAP49638 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTPAP49638 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTPAP49638 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTPAP49638 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTPAP49638 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTPAP49638 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
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